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Meta最新力作！经过训练的语言模型直接化身「造物主」，可以设计、生成蛋白质，生命的终极奥秘要被人工智能发现了吗？
AI在生物医学领域再次获得新进展。没错，这次还和蛋白质有关。
不同的是，过去的AI是发现蛋白质结构，这回开始自己设计和生成蛋白质结构了。如果说过去是「检察官」，现在说是进化成了「造物主」也不是不行。
参与本项研究的是Meta的AI研究机构中包括FAIR的蛋白质研究团队。作为在Facebook任职多年的首席AI科学家，YannLeCun也是第一时间转发了这个自家团队的成果，并给予高度评价。
BioRxiv上的这两篇论文是Meta在蛋白质设计/生成方面的「惊人」的成果。该系统使用模拟退火算法来寻找一个氨基酸序列，该序列的折叠方式符合所需的形状或满足约束条件（如对称性）。
ESM2，原子层级结构预测的模型
你猜的没错，这项研究和这两篇论文的基础，正是不久前由Meta提出的蛋白质预测和发现的大语言模型：ESM2。
这是一个亿参数的大模型。随着模型从万个参数扩展到0万个参数，内部表征中出现的信息能够在原子分辨率下进行三维结构预测。
利用大型语言模型来学习进化模式，可以直接从蛋白质序列中端到端地生成准确的结构预测，在保持准确性的同时，预测速度比当前最先进的方法快60倍。
事实上，借助于这种新的结构预测能力，Meta在短短两周内用一个由大约个GPU组成的集群上，预测出了图谱中超过6亿个宏基因组蛋白质的序列。
两篇论文的通信作者，来自MetaAI的AlexRives表示，ESM2语言模型展现出的通用性不仅超出了天然蛋白质的范围，而且还能够可编程地生成复杂和模块化的蛋白质结构。
蛋白质设计「专用编程语言」
工欲善其事，必先利其器。
为了让蛋白质设计和生成更有效率，研究人员在之前成果（主要是ESM2）的基础上，还专门开发了一种面向蛋白质设计的高级编程语言。
论文
