写在前面
R语言不仅在生物信息数据处理中发挥着重要作用，也是其它主流数据处理人士的首选工具。现在非常多自学生物信息学的小伙伴必须学的就是R，所以写一个R的系统性入门指导是非常有必要的。我作为老一辈的生信工程师，所以喜欢perl一点，排斥python。我也稍微看过一些python的语法，个人认为R和python几乎是一模一样的。R的特点就是内置了大量的函数，基本上你认识的英文单词都可以是一个函数，即使不是，你也可以自定义为函数。搞清楚了函数和变量，就可以看懂大部分的R代码了。
那么多编程语言，有何异同？下面是生信菜鸟团QQ群管理员赵云对这3种编程语言的心得体会！(菜鸟发言，如有误导，概不负责！)
python跟perl都是高级语言，两个开发的目的不同，perl更面向过程一些，优势是严谨，快。python主流面向对象编程，这个跟R类似，数据结构等方面有些不同，但可以互相调用。实际上以上三者之间可以互相调用部分功能。python的语法并不是很严谨，个人感觉，越偏向自然语言的编程语言越通俗但不严谨，以上，是跟C比较的。
R本身起源于S语言，是主要针对统计的，也是面向对象的。本质上，是把一个比excel功能强大的软件归零化成了命令行吧。excel高级应用也是要编程的，所以R的初级应用可以当成是没有用户交互界面的excel，细心一点，把示例代码都打对，当功能强大但不好使版的excel吧，这样至少心理上不会畏难跟抵触。
内部集成的越多，用户需要做的越少，你用C画个图累死你，用python得写几行，R一行就行了！
~~接下来是我写的了，六步系统入门R语言，都是重点~~
第一步：掌握必须要会的基础下载R语言的软件：