生物信息数据处理与Perl语言编程应用
时间地点
年6月26日-28日（报名中）上午9：30-12：00，下午13：30-17：00
课程内容
日期
授课题目
授课内容
第一天
概述
1.生物信息学数据处理概述；
2.Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围
运行调试
3.Perl语言解释器、编辑器安装；
4.Perl运行环境测试与程序编写；
5.UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理；
6.基于宏的perl语言快速编程
操作基础
7.Perl语言基本变量、操作符、判断结构；循环结构；
8.Perl语言常用函数的功能应用；
9.生物学数据文件的读入与输出；
10.生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等；
11.批量自动化数据文件操作
第二天
生物信息实例应用
12.常用生物信息学数据文件格式简介；
13.用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列；
14.用perl进行生物学数据文件格式转化；
15.用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息；
16.用perl批量自动化下载基因序列；
17.用perl进行DNA到protein批量翻译；
18.用perl批量DNA序列反向互补；
高级数据处理
19.Perl语言的数组、二维数组、hash表用法；
20.用perl自动化从表格数据提取信息；
21.矩阵数据文件的生成与应用
22.二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用
第三天
模块与子程序
23.perl子程序与模块应用；
24.强大的正则表达式的应用；
25.用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计；
Perl的高级应用
26.Perl第三方代码库CPAN的简介与应用；
27.Bioperl模块与应用；
28.常用生物信息学程序实例；
29.用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析；
30.基于perl的circos基因组作图工具介绍；
收费标准
注册费：元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）现金、支票、银行转账、银行汇款单位全称：北京市计算中心账号：开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行（汇款信息里备注上：“生物计算事业部——您的姓名”）报名优惠*策1、3人以上团体报名每人可减少元；2、4+1团报，可免费赠送一个名额上面优惠*策不能同时享受，只能享受其中一种。培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排
联系方式
于老师-，，邮箱：yurt
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